Please use this identifier to cite or link to this item: http://localhost:8080/handle/123456789/909
Title: Expressão de genes potencialmente envolvidos na patogenicidade de Aspergillus niger ao sisal
Authors: Jesus, Eliane Santos
Abstract: O sisal (Agave sisalana) é uma das poucas plantas capazes de sobreviver às condições edafoclimáticas da região semi-árida do Nordeste brasileiro. O sisal proporciona a obtenção de renda para milhares de famílias. No entanto, observa-se um declínio da cultura do sisal devido à podridão vermelha do caule do sisal, doença causada pelo fungo Aspergillus niger. Este trabalho tem como objetivo estudar a expressão de cinco genes do fungo potencialmente ligados a patogenicidade a plantas de sisal por meio de PCR quantitativo em tempo real (qPCR). Estes genes compreendem quatro enzimas hidrolíticas (celulase, cutinase, protease e lipase) e a micotoxina ocratoxina A. A dissertação é constituída de uma revisão de literatura e dois capítulos. A revisão de literatura contem dados sobre o sisal, podridão vermelha do caule do sisal, enzimas hidrolíticas e ocratoxina A. No primeiro capítulo estudou-se a expressão de genes potencialmente envolvidos na interação entre A. niger e sisal em condições simuladas da interação in vitro. Primers para enzimas hidrolíticas e ocratoxina A foram desenhados e otimizados para qPCR. Observou-se maior expressão dos genes em meio suplementado com extrato de sisal do que em meio mínimo. No segundo capítulo foram feitas tentativas de se estudar a expressão de genes potencialmente envolvidos na patogenicidade de A. niger e genes de defesa de sisal contra o fungo em condições in vivo. No entanto, devido à ineficiência dos primers dos genes de defesa e ausência do material genético do fungo, a amplificação dos genes nas amostras in vivo não pode ser realizada com sucesso. Outros estudos serão realizados para a otimização da extração de RNA da interação entre A. niger e sisal. Os dados apresentados são os primeiros a abordar os mecanismos de patogenicidade de A. niger ao sisal.
Sisal (Agave sisalana) is one the few plants able to survive the conditions of the Brazilian Semi-arid Northeast region. This crop allows thousands of people to obtain minimal wages. However, there is a decline of the crop caused by the fungus Aspergillus niger. The objective of this work was to study the expression of five A. niger genes putatively involved in the pathogenicity to sisal through quantitative real time PCR (qPCR). These genes comprise four hydrolytic enzymes (cellulase, cutinase, protease and lipase) and the mycotoxin ocrhratoxin A. The dissertation is composed of one literature review and 2 chapters. The literature review contains information about sisal, the bole rot disease, hydrolytic enzymes and ochratoxin A. In the first chapter the expression of genes potentially involved in the pathogenicity of A. niger to sisal were studied in an in vitro simulated interaction. Primers for hydrolytic enzymes and ocrhratoxin A were designed and optimized for qPCR. Higher expression of all genes was observed in medium supplemented with sisal extract than in the minimal medium. In the second chapter an attempt to study the expression of genes putatively involved in pathogenicity of A. niger and in the defense of sisal plants against the fungus in in vivo conditions. However, it was not possible to amplify the target genes due to primer inefficiency or lack of fungal DNA. Other studies will be carried out in the future to optimize the extraction of RNA from the interaction. These data are the first to focus on the mechanisms of pathogenicity of A. niger to sisal.
Keywords: Sisal - Controle biológico
Sisal - Fungos fitopatogênicos
Enzimas - Genética - Análise
URI: http://hdl.handle.net/123456789/909
Issue Date: 11-Jan-2016
Appears in Collections:CCAAB - Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agrícola (Dissertações)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Eliane Santos Jesus - Mestrado em Microbiologia Agrícola.pdf1,1 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.