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Title: Seleção de descritores e análise de agrupamento em acessos de tabaco
Authors: Conceição, Antonio Leandro da Silva
metadata.dc.creator: Conceição, Antonio Leandro da Silva
Abstract: Objetivou-se com este estudo selecionar descritores morfoagronômicos e determinar sua importância relativa na caracterização, bem como propor um número mínimo capaz de quantificar a divergência genética existente entre acessos de tabaco tipo Sumatra e aplicar diferentes metodologias de análise de agrupamento com base na análise simultânea e individual por meio dos descritores quantitativos e qualitativos selecionados. Para a caracterização dos acessos inicialmente foram usados 43 descritores morfoagronômicos, sendo 17 quantitativos e 26 qualitativos. Foi realizada a identificação dos descritores quantitativos redundantes, por dois procedimentos: 1) seleção direta, proposta por Jolliffe e 2) Seleção baseada no coeficiente de Singh. A seleção dos descritores qualitativos foi realizada por meio do nível de entropia dos caracteres (H), proposto por Renyi. Foram selecionados 10 descritores quantitativos e 8 descritores qualitativos. Todos esses descritores selecionados são importantes na caracterização do germoplasma de tabaco em estudo. O descarte de 58% dos descritores não provocou perda de informação considerável, uma vez que os descritores redundantes estão correlacionados aos descritores remanescentes. Para a análise de divergência foram utilizados os métodos de agrupamento UPGMA e WARD, em que o método UPGMA foi o que melhor explicou a divergência genética entre os acessos em estudo. Foram utilizadas para as análises individuais as distâncias de mahalanobis e euclidiana média, para obtenção das matrizes oriundas dos dados quantitativos. Para os dados qualitativos originais e dados quantitativos transformados foi utilizada a distância de Cole-Rodgers. Para as análises simultâneas dos dados quantitativos e qualitativos foram testadas três metodologias distintas: O algoritmo de Gower; Soma algébrica de matrizes individuais e integração de dados por meio da transformação de caracteres quantitativos em multicategóricos por duas estratégias distintas (Regra de Sturges e Regra da raiz quadrada). Os valores de correlação entre as matrizes de dados quantitativos transformados e quantitativos originais foram significativos a 1 e a 5% de probabilidade, sendo um deles de alta magnitude, oferecendo suporte para extrapolar os resultados de um conjunto de dados para outro. Com isso, a estratégia da raiz quadrada foi a mais indicada, com correlação de 0,75 e 0,82 entre as matrizes de dissimilaridade dos dados codificados e quantitativos originais. Como critério para definição do número ótimo de grupos foi usado o índice Pseudo-t2, com este, foi possível a formação de 3 grupos pelo método UPGMA para todas as metodologias de análise simultânea utilizadas. O acesso A14 (125 PD) possui comportamento distinto dos demais e as metodologias de análise simultânea, com base nas matrizes de distâncias geradas, captaram essa divergência. Todas as matrizes de análise conjunta foram comparadas, mostrando grande correspondência entre as mesmas, com altas correlações que variaram de 0,824 a 0,998. Os resultados deste trabalho mostraram que as metodologias de análise simultânea foram eficazes em relevar a existência de divergência genética entre acessos de Nicotiana tabacum L. tipo Sumatra e mostram a importância da combinação de métodos, uma vez que puderam otimizar, de forma considerável, a interpretação dos resultados para maior conhecimento do germoplasma em estudo.
This study aimed to select descriptors morphological and agricultural traits and determine their relative importance in the characterization, as well as propose a minimum number to quantify the genetic divergence between accessions of tobacco type Sumatra and apply different methods of cluster analysis based on the simultaneous analysis and individual by means of quantitative descriptors and qualitative selected. For the characterization of accessions were initially used 43 descriptors morphological and agricultural traits, being 17 quantitative and 26 qualitative. Was the identification of quantitative descriptors redundant, by two procedures: 1) direct selection, proposal by Jolliffe and 2) Selection based on the coefficient of Singh. The selection of qualitative descriptors was performed by means of the entropy level of the characters (H), proposed by, Renyi's series. 10 Were selected quantitative descriptors and 8 qualitative descriptors. The disposal of 58% of the descriptors has not lost considerable information, since the descriptors are correlated with the remaining descriptors. For the analysis of divergence were used methods UPGMA and WARD, in which the UPGMA method was the best explained the genetic divergence among the accessions into study. They were used for the individual analyzes the Mahalanobis distance and Euclidean average for obtaining the arrays from the quantitative data and the qualitative data and original quantitative data processed was used the distance of Cole-Rodgers. For the simultaneous analysis of quantitative and qualitative data were tested three different methodologies: The algorithm of Gower; algebraic Sum of individual arrays and data integration through the transformation of quantitative traits in multicategoric by two distinct strategies (Rule of Sturges and Rule the square root). The correlation values between the arrays of quantitative data processed and original quantitative were significant at 1 and 5% of probability, one of them being of high magnitude, offering support to extrapolate the results of a set of data to another. With this, the strategy of square root was the most indicated, with a correlation of 0.75 and 0.82 between the arrays of dissimilarity of encoded data and quantitative originals. As a criterion for the definition of the optimal number of groups was used the index Pseudo-t2, this was possible the formation of 3 groups by UPGMA method for all the methodologies of simultaneous analysis used. Access to14 (125 PD) has distinct behavior of others and the methodologies of simultaneous analysis, based on matrices of distances generated, captured this divergence. All arrays of joint analysis were compared, showing great correspondence between them, with high correlations ranged from 0.824 to 0.998. The results of this work showed that the methodologies of simultaneous analysis were effective in identifying the existence of genetic divergence among accessions of Nicotiana tabacum L. type Sumatra and show the importance of the combination of methods, since they have been able to leverage a significant way to the interpretation of the results for greater knowledge of germplasm in study.
Keywords: Fumo – Cultivo
Fumo – Recursos genéticos vegetais
Diversidade genética – Descritores
Germoplasma vegetal – Análise
URI: http://hdl.handle.net/123456789/944
Issue Date: 1-Feb-2016
Appears in Collections:CCAAB - Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais (Dissertações)

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